El Instituto Vega del Jarama está localizado en San Fernando de Henares, localidad de 35.466 habitantes, situada a unos 20 kilómetros de Madrid. El término municipal adopta la forma de "L" estando limitado en parte por los ríos Jarama y Henares, confluyendo ambos en el límite sur del término. La superficie total de la localidad es de 39,29 Km2.

El Instituto Vega del Jarama es uno de los más antiguos de la zona. Desde 1974 es Centro de Bachillerato con doble turno (diurno y nocturno). En octubre de 1987 se construyó un nuevo edificio (el actual de la Avda. de Irún). A partir de 1994-95, con motivo de la implantación de la LOGSE, pasó a denominarse Instituto de Enseñanza Secundaria (IES). Desde entonces, paulatinamente se ha ido implantando el nuevo sistema educativo y se ha ido abandonando el BUP y el COU. El edificio situado en la Avda. Sánchez Ferlosio s/n en San Fernando de Henares, antiguo colegio Mª Antonia Goñalons, pasa a formar parte del Instituto Vega del Jarama en 1999. El nombre Vega del Jarama se impuso en 1981 a propuesta del Claustro de profesores en alusión a las actividades agrícolas propias del entorno del Instituto.